常州市第三人民医院始建于1956年，原名常州市传染病医院，现址建于1981年，更名为常州市第三人民医院，2010年常州市眼耳鼻咽喉医院成建制并入，医院更名为常州市第三人民医院、常州市眼耳鼻咽喉医院、常州市中西医结合医院。2000年、2011年分别成为苏州大学、南京医科大学临床教学医院。经过半个多世纪的努力，医院已建设成为集医疗、科研、教学、预防为一体的具有显著专科特色的三级甲等现代化医院，并承担着区域性突发公共卫生事件的临床救治任务。
医院占地面积5万平方米，建筑面积10.3万平方米 ，编制、开放床位900张, 设有一级诊疗科目19个,二级诊疗科目40个。医院现有职工1050名，其中高级以上职称237名，硕士及以上学历125名。医院设有行政、临床及医技科室58个，其中感染科为江苏省省级临床重点专科；中西医结合肝病科、眼科、耳鼻咽喉科为江苏省中医临床重点专科；肝病科、结核科、检验科、麻醉科、肝胆外科、眼科、耳鼻咽喉科为常州市临床重点专科，肝病科为常州市重点学科，检验科为常州市级重点医学实验室。眼科为基层特色科室市级孵化中心，麻醉科、眼科、耳鼻咽喉科、感染科为市级医疗质量控制中心挂靠单位，中西医结合肝科为中医临床诊疗中心。在2018年中国百家医院最有影响力的专科排名中，感染科排31位，眼科排34位。
一直以来,常州三院通过强化领导、建章立制、加强培训、开展演练，全面构建公共卫生应急救治体系，不断提高医疗救治水平，出色完成了甲流感、禽流感、 9.28 危化品泄漏事件等救治任务，成功救治了全球首例H7N4病例和10余例重症妊娠期急性脂肪肝产妇患者,保障了人民群众的生命安全。2016年3月，作为常州市重点民生工程之一的常州市第三人民医院公共卫生临床中心项目正式开工建设，该项目总投资约4.13亿元，新建面积近5万平方米。至2018年10月，公卫临床中心门诊楼、病房楼、医技科研教学综合楼全部投入试运行，医院面貌焕然一新。
2020年，一场新冠肺炎疫情来袭，常州三院作为全市新冠肺炎疫情定点救治医院，临危受命，勇挑重任。历时100多天奋战，53名确诊患者全部治愈出院，实现了患者 零重症、零死亡 、医务人员 零感染 的目标。
医院紧紧围绕 以病人为中心、以质量为核心 ，坚持 做强做大专科，做精做优综合，建设具有显著专科特色的现代化三级甲等传染病医院 的发展愿景，不断提高医疗质量和服务水平，先后荣获全国模范职工之家、全省卫生健康系统先进集体、常州市先进基层党组织、常州市五一劳动奖状、常州市文明单位等称号。在刚刚公布的中国医院公益风云榜上，医院荣获 十佳公益战略管理医院 称号，位列2020年度中国医院公益风云榜百强第32位，常州三院将继续秉承 真诚服务、精心诊治、以人为本、关爱生命 的服务宗旨，为百姓健康护航，为民生幸福助力。
