氾水镇中心卫生院成立于1950年，承担全镇近10万人口的医疗、预防保健及公共卫生服务，同时也担负本县南片区域近20万人的120急诊、急救转运工作。扬州市重点打造的18家区域医疗卫生中心之一。异地新建并于2017年10月投入使用的医院占地55亩，建筑面积16300㎡，总投资7000万元，按二级医院规模设计，设置床位180张，6个临床科室，1个省特色专科，8个医技科室，3个病区。2019年门诊12万人次，收住病人3500余人次。现有职工150人，卫技人员占95%，中、高级职称59人。村卫生室25个，其中省示范卫生室12个。首批成功创成 江苏省示范乡镇卫生院 、 省示范中医科 ，首批认定的 中医类别全科医生规范化培养基地（基层培养基地） 。 中医老年病科 是扬州市基层医疗机构特色科室，同时也是宝应县基层医疗机构中创成的第一个省级特色专科，2016年被国家卫计委确认为群众满意的乡镇卫生院 ，2018年被省卫计委确定为首批基层卫生人员实训基地建设单位，同年成功创成二级综合医院。
