南京市高淳中医院始建于1986年，是一所集医疗、教学、科研、预防保健为一体的综合性二级甲等中医医院。是南京中医药大学实习基地，江苏健康职业学院教学医院，为南京市中医院高淳分院、江苏省人民医院、江苏省中医院专科联盟单位。医院占地面积2.6万平方米，建筑面积5万平方米。
医院核编床位430张。设有8个标准病区，南京市中医重点专科4个（针灸科、肛肠科、儿科、脾胃病科），南京市中医重点专科建设单位4个（呼吸科、骨伤科、脑病科、急诊科）。医院临床科室建设齐全，拥有重症医学科、内科、外科、妇科、骨伤科、急诊科等临床科室28个，医技科室7个。心血管科为省人民医院心血管协作分中心，消化科为省人民医院消化科的孵化基地，肛肠科为南京市中医院全国肛肠中心技术协作中心。有市级及以上科研项目3项，其中，省级科研1项，市级科研2项，3项均为中医药类别项目。
现有职工600余名，其中, 博士生3人，硕士生36人，本科生310人；高级职称77名，中级职称160名，南京市名中医3人。
医院有飞利浦1.5TMR、飞利浦64排CT、岛津DSA、高压氧舱、椎间孔镜、关节镜、腹腔镜、奥林巴斯超声内镜、纤支镜、膀胱镜、输尿管软、硬镜等万元以上设备615台，设备总值1.03亿。
