常熟市中医院始建于1958年，2003年和常熟市妇幼保健院合并，2011年通过评审成为三级乙等中医医院。目前，医院本部占地面积8.7万平方米，建筑面积10.3万平方米，核定床位850张，另设独立虞山国医馆。下辖区域医共体1家，专科医共体19家。
医院是南京中医药大学附属医院，天津中医药大学、苏州大学教学医院，国家中医药管理局 治未病 预防保健服务试点单位、中医药康复服务能力建设单位，香港艾力彼中国县级医院竞争力排行榜百强医院。先后荣获江苏省文明单位、江苏省爱婴医院、江苏省中医药科学技术奖、江苏省社会哲学成果奖、常熟市文明单位等荣誉。
医院拥有国家中医药管理局中医重点专科1个，国家级救治中心2个，江苏省中医重点专科3个，江苏省防治中心1个，苏州市中医重点专科4个，苏州专科救治中心5个，常熟市临床重点专科4个，常熟市中医重点专科4个。肛肠科、骨伤科、肾病科、肿瘤科、妇产科、儿科在常熟乃至苏州地区享有较高声誉。2008年建成 常熟中医药博物馆 ，拥有珍贵馆藏500多件，为江苏省爱国卫生教育、健康教育基地，苏州市、常熟市科普教育基地。 2015年成立吴门医派虞山医学研究所，流派研究成果丰硕。
医院设有虞山国医馆和中医特色诊疗区，设立儿科、肛肠科全国名中医传承工作室，成立县级首家胃食管反流专病中心，拥有全国基层名老中医专家传承工作室、省级名中医工作室4个。拥有批准文号自制制剂54种，其中中药制剂50个品种。妇幼医疗保健服务特色鲜明，孕妇分娩率占全市分娩总数的60%以上。
医院始终保持中医为本，中西医并重的发展方向，秉承 精诚、博爱、传承、创新 的院训，以建设 环境精美、服务精诚、质量精优、管理精细 的 精致医院 为目标，紧紧围绕 中医中药、妇幼保健、急诊急救、慢病管理 四大特色，以三级甲等中医医院创建为目标，创新发展，追求卓越。
