苏州市疾病预防控制中心于2001年10月由原市卫生防疫站、市血吸虫病防治站、市皮肤病防治所、市结核病防治所、第五人民医院预防门诊部、市职业病防治所以及市健康教育所等七家单位组建而成，是苏州市卫生健康委直属的公益一类事业单位，也是苏州市级唯一全额拔款的公共卫生事业单位；承担着全市疾病预防与控制，突发公共卫生事件应急处置，疫情及健康相关因素信息管理，健康危害因素监测与干预，实验室检测分析与评价、健康教育与健康促进、技术管理与应用研究指导等职能。中心始终坚持公益属性，以推进健康苏州建设为契机，以能力提升为重心，强化人才队伍建设，全力为市民提供公共卫生服务，为市委、市政府打赢疫情保卫战提供强有力的公共卫生技术支撑。

依照市政府提出 建设面向未来、国际标准，建设具有苏州特色的整合型、创新型、智慧型的疾控中心 的要求，苏州市疾控中心将在2022年底完成异地迁建。