宿迁市宿城区疾病预防控制中心于2008年3月28日正式挂牌成立，为副科级单位，经费渠道为财政全额拨款。中心分设6个科室：综合科（检验及质量管理科）、传染病防制科（学校卫生科）、免疫规划科、职业卫生科（地方病与寄生虫病防制科）、健康教育科、食品安全与慢性非传染病防制科。

宿迁市宿城区龙河人民医院是2019年宿城区人民政府按照二级综合医院标准投资兴建的公立医院，是省农村区域性医疗卫生中心重点项目，是市、区重点民生建设工程，承担着辖区及周边乡镇近16万余群众的医疗保障任务。医院开设科室：内科、外科、妇产科、儿科、口腔科、急诊医学科、中医科、康复医学科、麻醉科、医学检验科、医学影像科、超声科等。

宿迁市宿城区运河宿迁港中心医院位于运河宿迁港产业园内。医院占地面积27亩，总建筑面积约3.7万平方米，总投资3.2亿，按照二级综合医院标准设计建设，主要建设门诊楼、住院楼、发热门诊楼以及相关配套附属设施。内设15个科室，5个病区，150余张床位，为周边百姓提供医疗、预防、保健、健康教育、康养等综合医疗卫生服务。宿迁市宿城区运河宿迁港中心医院项目已于2022年10月启动，计划2024年底投入使用。