昆山市疾病预防控制中心成立于2001年12月，人员构成核定编制196个，现在编在岗137人，其中卫生专业技术人员114人，中高级专业技术职称86人，占75.4%，本科及以上学历人员102人，占89.5%。科室介绍内设17个科室，承担全市重大传染病、慢性非传染性疾病、地方病等预防与控制、健康危害因素监测与干预、突发公共卫生事件应急处置、公共卫生检测等职能。

近年来，中心先后荣获全国疾病预防控制工作先进集体、江苏省疾病预防控制工作先进集体、江苏省青年文明号、苏州市工人先锋号、苏州市疾病预防控制工作先进集体、苏州市文明单位、苏州市抗击新冠肺炎疫情先进集体、苏州市卫健系统新冠肺炎疫情防控集体记功、昆山市抗击新冠肺炎疫情先进集体等荣誉称号。