淮安市疾病预防控制中心（淮安市卫生检测检验中心）为淮安市卫生健康委下属的全额拨款公益性事业单位，于2003年3月根据疾病预防控制体制改革的要求，在原淮安市卫生防疫站的基础上组建成立，主要承担全市疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情报告及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与控制、实验室检测与评价、健康教育与健康促进、技术指导与应用研究等政府对社会的疾病预防控制职能。
中心主办公区建筑面积近3万㎡（淮安市枚皋路6号），独立实验楼1.3万㎡，具有优美的内外环境、一流的办公条件、现代化的卫生应急处置指挥中心和健康教育演播大厅、设施完善的职工活动中心、大型正规食堂。下设办公室、财务科、应急办、质量管理科、科教信息科、后勤保卫科、传染病防治科、慢性病地方病防治科、消毒与媒介生物防治科、公共卫生科、营养与食品卫生科、皮肤性传播疾病防治科（性病艾滋病防治科）、结核病防治科、预防性体检科（皮肤病医院门诊部）、检验科、健康教育所、12320公共卫生电话呼叫中心17个科室。
